Μοριακή ταυτοποίηση απομονώσεων του βακτηρίου Pseudomonas viridiflava από διάφορους ξενιστές.

dc.creatorΜπαλαντινάκη, Ευαγγελίαel
dc.creatorMpalantinaki, Euangeliaen
dc.date.accessioned2016-03-15T12:30:56Z
dc.date.available2016-03-15T12:30:56Z
dc.date.issued2012-03-29T10:14:41Z
dc.description.abstractΤο βακτήριο Pseudomonas viridiflava θεωρείται ότι είναι ένα κοσμοπολίτικο, ευκαιριακό παθογόνο με μεγάλο εύρος ξενιστών. Aνήκει στα φθορίζοντα πηκτινολυτικά βακτήρια και στην ομάδας II των δοκιμών LOPAT, με φαινότυπο (- - + - +). Στην Ελλάδα, το βακτήριο έχει αναφερθεί ως το παθογόνο αίτιο της νέκρωσης της εντεριώνης της τομάτας, της βακτηριακής σήψης της τομάτας, της μελιτζάνας, της πιπεριάς και του χρυσάνθεμου, της βακτηριακής κηλίδωσης της τομάτας, βλήτου, μελιτζάνας, πεπονιάς, αγγουριάς, αγκινάρας, σέλινου, άκανθου και συγκόνιου. Επιπλέον, το βακτήριο έχει αναφερθεί ως ένα πραγματικό ή ευκαιριακό παθογόνο στο ακτινίδιο, στο ραπανάκι, στη φασολιά, στο κρεμμύδι, στη μηδική, στο δαύκο, στην ποισέντια, στην τομάτα και σε πληθώρα άλλων φυτών. Σκοπός της εργασίας αυτής είναι να επιβεβαιωθεί βιοχημικά και μοριακά ο προκαταρτικός προσδιορισμός των βακτηριακών στελεχών ως Pseudomonas viridiflava που υπήρχαν στη συλλογή του εργαστηρίου Βακτηριολογίας του ΤΕΙ Κρήτης. Από 64 απομονώσεις του βακτηρίου, επιλέχθηκαν 26 από διάφορους ξενιστές και αφού επιβεβαιώθηκε η φαινοτυπική ταυτοποίησή τους και ελέγχθηκε η παθογένειά τους, προχωρήσαμε στη μοριακή ταυτοποίηση των 18 εξ αυτών. Από τα αποτελέσματα που προέκυψαν με βάση το μορφολογικό, φυσιολογικό, βιοχημικό φαινοτυπικό προφίλ αλλά και τις δοκιμές παθογένειας, επιβεβαιώθηκε ότι όλα τα βακτηριακά στελέχη ανήκουν στο βακτήριο Pseudomonas viridiflava. Στο ίδιο συμπέρασμα καταλήξαμε χρησιμοποιώντας τη μεθοδολογία αποτύπωσης μέσω της αλληλούχισης πολλαπλών γενωμικών περιοχών (Multilocus Sequence Typing, MLST) με τη χρήση των γονιδίων gyrB, rpoD και rpoB. Οι αλληλουχίσεις των τριών γονιδίων έδειξαν πολύ υψηλή ομολογία με τα στελέχη αναφοράς του Pseudomonas viridiflava που είναι καταχωρημένα στη βάση δεδομένων National Center for Biotechnology Information (NCBI).el
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12688/607
dc.languageel
dc.publisherΤ.Ε.Ι. Κρήτης, Σχολή Τεχνολογίας Γεωπονίας και Τεχνολογίας Τροφίμων (Σ.Τε.Γ.Τε.Τ), Τμήμα Φυτικής Παραγωγήςel
dc.publisherΤ.Ε.Ι. Κρήτης, Σχολή Διοίκησης και Οικονομίας (Σ.Δ.Ο), Τμήμα Τεχνολόγων Γεωπόνωνel
dc.publisherT.E.I. of Crete, School of Agriculture, Food and Nutrition (STeGTET), Department of Crop Scienceen
dc.publisherT.E.I. of Crete, School of Agriculture, Food and Nutrition (STeGTET), Department of Agricultureen
dc.rightsAttribution-ShareAlike 4.0 International (CC BY-SA 4.0)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
dc.titleΜοριακή ταυτοποίηση απομονώσεων του βακτηρίου Pseudomonas viridiflava από διάφορους ξενιστές.el
dc.titleMolecular identification of isolates of the bacterium Pseudomonas viridiflava from various hosts.en
heal.academicPublisherIDteicrete
heal.advisorNameΓκούμας, Δημήτριοςel
heal.advisorNameGkoumas, Dimitriosen
heal.fullTextAvailabilitytrue
heal.keywordβακτηρίο Pseudomonas Viridiflava, μοριακή ταυτοποίησηel
heal.keywordmolecular identification, bacterium Pseudomonas viridiflavaen
heal.typebachelorThesis
nm.hasExtrafalse
nm.originalItem/home/admin/content_to_import/browse/steg/fp/2012/MpalantinakiEuangelia
tcd.distinguishedfalse
tcd.surveyfalse
Αρχεία
Πρωτότυπος φάκελος/πακέτο
Τώρα δείχνει 1 - 1 of 1
Φόρτωση...
Μικρογραφία εικόνας
Ονομα:
Mpalantinaki2012.pdf
Μέγεθος:
2.75 MB
Μορφότυπο:
Adobe Portable Document Format